U Specijalnoj bolnici se organizuju sledeće jedinice:
I Odeljenje za bolničko lečenje odraslih od nespecifičnih plućnih bolesti
II Odeljenje za bolničko lečenje dece od nespecifičnih plućnih bolesti
III Odeljenje za prijem, specijalističko – konsultativnu delatnost, laboratorijsku i radiološku dijagnostiku i dnevnu bolnicu
IV Služba za fizikalnu medicinu i rehabilitaciju odraslih i dece
V Služba za pravne i ekonomsko-finansijske poslove
VI Služba za tehničke i druge slične poslove
Uprava bolnice:
- Dr Filipović Ivana, v.d. direktora Bolnice
- Prim. Dr Vidanović Gordana, pomoćnik direktora specijalne bolnice
- Đorđević Milena, pomoćnik direktora specijalne bolnice